El CIBERES cuenta con dos programas transversales: Formación e Internacionalización. El programa de Formación favorece entre los grupo la adquisición de conocimiento, fomenta el interés en la investigación en enfermedades raras y facilita la interacción y movilidad de los investigadores. Por su parte, el programa de Internacionalización promueve la participación de sus investigadores en los programas europeos para mejorar la influencia internacional en estructura cooperativas europeas y el retorno económico.
